それから約50年。世紀末を迎えても未だ幻獣との戦いは続いていた。もちろん日本とて例外ではなかった……。
1998年9月――。大陸を抑えた幻獣たちは、大方の予想を越えて九州中部に上陸。日本自衛軍は持てる戦力をすべて動員し限定的勝利を得るも、戦力の8割を喪失して無力化する。九州中央部、熊本県以外の全県を放棄して民衆を逃がし、熊本を要塞化して本州と四国防衛の時間稼ぎとした。

その一方で、幻獣たちに襲われ続け、疲弊した日本政府は非常の決断をする。少年兵の強制招集である。本土防衛のための“大人の兵士”が練成されるまでの時間を稼ぐため、14歳から17歳までの徴兵規定年齢に達していない十万人もの子供たちが集められたのだ。

『ガンパレード』シリーズの世界は様々な事情を抱えた少年少女たちが、戦車高校という戦うための学校へ集められるところから始まる……。

青森を護る日本自衛軍・第108警護師団は、主として比較的安全な北海道との連絡線を防衛・警備することを任務としていた。そのためほとんど車両を持たない機動力に乏しい部隊であり、隊員たちも実戦経験のないものたちが多く存在していた。

しかし、そこを幻獣に狙われた。

幻獣たちは次なる目標を北海道と本州を繋ぐ青森に絞り、強襲！　青森は各地で分断され、108警護師団は小部隊ごとに分散したまま混乱の中で各自防戦することになる。

今回は第108警護師団の中でも“ヒロイン天国小隊”と呼ばれる歩兵部隊を中心にストーリーが展開される。“ヒロイン天国小隊”には、強い女性、優しい女性、可憐な女性、女性みたいな男などなど、様々な女性と、女性でない者たちが所属している。

その“ヒロイン天国小隊”に所属するキャラクタたちとプレイヤーが、新たな『ガンパレード』の世界をつくりあげるのだ。